Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms