Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms