Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR2Q9BYE9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR2Q9BYE9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR2Q9BYE9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR2Q9BYE9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR2Q9BYE9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR2Q9BYE9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms