Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms