Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BBS2Q9BXC9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms