Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYCP2Q9BX26 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2Q9BX26 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms