Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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MMP19Q99542 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP19Q99542 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms