Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EYA3Q99504 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms