Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCHS1Q96JQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms