Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRIQ1Q96JM4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
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