Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C7orf43Q8WVR3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms