Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms