Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms