Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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