Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PAXIP1Q6ZW49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms