Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms