Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKIDA1Q1XH10 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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