Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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