Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL19A1Q14993 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL19A1Q14993 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL19A1Q14993 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL19A1Q14993 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL19A1Q14993 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL19A1Q14993 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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