Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFIXQ14938 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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