Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL4Q14135 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms