Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATMQ13315 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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