Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPA4Q13156 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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