Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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