Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDR1Q08345 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms