Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNG1Q06432 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms