Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms