Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP98P52948 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP98P52948 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP98P52948 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms