Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD27P26842 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD27P26842 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD27P26842 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD27P26842 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD27P26842 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms