Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMA1P25391 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms