Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms