Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms