Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms