Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UFL1O94874 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFL1O94874 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms