Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC5O75140 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC5O75140 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DEPDC5O75140 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC5O75140 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms