Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO3O43524 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms