Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms