Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCAO15360 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCAO15360 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCAO15360 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCAO15360 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCAO15360 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms