Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIEO00221 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms