Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms