Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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