Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
E9PCH4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
E9PCH4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
E9PCH4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PCH4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PCH4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PCH4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E9PCH4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9PCH4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms