Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms