Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD3A6NKT7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms