Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms