Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT1A5YKK6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms