Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TAF1CQ15572 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TAF1CQ15572 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms