Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SNX17Q15036 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SNX17Q15036 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SNX17Q15036 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNX17Q15036 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNX17Q15036 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX17Q15036 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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