Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXF2Q12947 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXF2Q12947 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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