Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEMA3FQ13275 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEMA3FQ13275 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms